根据搜索结果，南京市玄武中等专业学校的主校区为 花园路校区，具体信息如下：
地理位置
花园路校区位于南京市玄武区花园路6号，是学校的主要教学区域。
规模与功能
该校区设有艺术系和国际部，涵盖中专、综合高中、开放专科等办学层次，是学校“一主两翼”办学格局中的核心部分。
其他校区补充说明
- 樱驼花园校区（樱驼花园100号）和仙鹤门校区（仙鹤门）分别为现代服务系、信息技术系和五年制高职专业提供教学服务。
综上，花园路校区是玄武中专的主校区，承担主要教学和管理功能。
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