根据权威信息源综合分析，中国交通运输专业顶尖高校主要集中在以下五所院校：
- 全国排名第一，交通运输工程学科为A+，世界一流建设学科，覆盖铁路、公路、水运、航空等多领域，科研实力突出。
北京交通大学
- 全国排名第二，交通运输工程学科为A-，铁路运输、城市轨道交通方向优势显著，与铁路总公司共建，实践资源丰富。
同济大学
- 全国排名第三，交通运输规划与管理学科为A-，学术水平高，工程实践项目成果显著，国际化视野强。
长安大学
- 全国排名第四，交通运输学科通过整合多学院实现交叉融合，跻身A类学科，亚洲第一公路交通大学声誉卓著。
东南大学
- 全国排名第五，交通运输工程学科为A+，双一流建设学科，实验室设施先进，实践机会多。
其他高排名院校：
中南大学（A-）、北京航空航天大学（A-）、大连海事大学（海运特色）、武汉理工大学等在细分领域表现突出。
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