南京古代学校分布广泛，以下为主要学府的地理位置及历史背景：
- 位置：
现鸡笼山以南（旧址）
- 历史：明朝开国都城最高学府，洪武十五年（1382年）建成，后历经多次更名，1988年东南大学校址沿用其基础。
- 位置：
清凉山东侧山坡（现南京钟山风景区）
- 历史：明嘉靖年间由督学耿定向创建，培养了明代首位状元焦竑，是江南地区最大书院。
- 位置：
江宁府三茅山（今句容茅山）
- 历史：北宋时期由侯遗创建，宋初四大书院之一，以理学教育著称。
- 位置：
建康府城（今南京）
- 历史：南宋淳祐元年（1241年）由吴渊创建，规模宏大，为当时官立府级书院。
- 位置：
太平南路白下会堂附近（现南京）
- 历史：清雍正元年（1723年）由两江总督查弼纳倡建，以学术研究为主。
补充说明：
国子监旧址现存部分遗迹，但无完整建筑群；
其他书院多位于南京周边县市（如句容、钟山），属江南地区教育中心。
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