根据搜索结果，制药工程专业大专生可考取以下证书，结合专业特点和职业发展需求：
适用于药品生产、经营、使用等环节，需通过全国统一考试并注册。该证书是药学领域核心从业资格，与制药工程专业高度相关。
药剂师证
负责药物知识及药事服务，报考条件与执业药师相近，适合希望在药品相关领域发展的学生。
注册化工工程师证
作为工科交叉领域的重要证书，适用于药品生产、工艺研发等环节，符合制药工程专业培养目标。
执业医师资格证
若未来从事医疗相关岗位，需通过医师资格考试。但该证书对专业要求较高，需具备医学背景。
英语四六级证、计算机二级证
通用性证书，提升就业竞争力，尤其在研发、管理等领域有辅助作用。
建议：
优先考取执业药师证或注册化工工程师证，结合专业方向和职业规划选择。若涉及医疗领域，可考虑医师资格证，但需额外学习医学知识。
温馨提示：
