南京大学集中区域主要集中在以下三个大学城，其中仙林大学城高校密度最高：
集中了南京大学、南京师范大学、南京邮电大学、南京中医药大学、南京财经大学等多所知名高校，是南京大学群的核心区域。
江宁大学城（江宁区）
涵盖东南大学、南京航空航天大学、河海大学、中国药科大学、南京医科大学等重点院校，其中东南大学为中部属院校代表。
浦口大学城（浦口区）
以南京工业大学、南京信息工程大学、南京审计大学、南京农业大学为主，老校区与新建校区分布结合。
其他说明：
鼓楼区（玄武区）虽历史悠久，但高校分布相对分散，主要集中南京大学、河海大学等少数院校。- 部分非大学城区域（如南京理工大学、南京林业大学）高校数量较少，已逐渐向大学城转移。
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