根据搜索结果，上海补办就业协议书的流程如下，具体操作以学校和用人单位要求为准：
一、补办流程
登报声明作废
在上海市级报刊（如《上海日报》）刊登声明，注明个人基本信息、就业协议编号及作废声明。
提交审核材料
- 携带登报声明的报纸原件及复印件；
- 身份证、毕业证等身份证明材料；
- 系部就业指导老师签署的书面意见。
学校审核与补发
将上述材料提交至学校就业指导中心或招生就业办审核，审核通过后补发新协议。补发协议会标注“原件已遗失，此份为遗失补办件”。
二、注意事项
补办过程中需确保材料真实有效，避免诈骗风险；
若学校有代办点（如学院就业中心），可优先咨询具体流程；
若用人单位要求，可同时与单位沟通说明情况。
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