就业局管理档案的方式主要包括以下几个方面：
采用竞争性磋商方式，选取专业档案公司对库存档案进行全面清理和录入系统，实施数字化管理。例如，盘龙区就业局通过这种方式确保了档案整理工作的安全性、保密性和规范性。
在档案整理过程中，严把“安全关”、“质量关”和“保密关”。包括制定详细的整理时限、质量要求、验收办法和保密安全措施，指派专人监督第三方整理录入工作，并进行全面核实，确保录入数据的准确性。
个人就业档案实行集中统一管理原则，档案柜要保持清洁，所有归档文件材料要进行认真鉴别、全面清理和如实登记造册，并按照质量要求进行规范装订和统一编号，确保资料齐全、完整、准确、系统。
接收转交个人就业档案材料时，要在档案交接登记表上认真做好交接登记，标明交接时间，并经交接双方签字认可，以确保档案管理的可追溯性。
根据我国档案管理的相关规定，档案不允许个人保存，无档案管理权限的企事业单位应由各地的人才交流中心或政府批准的人才服务机构提供档案管理等服务。
综上所述，就业局通过数字化管理、严格的质量控制、集中统一管理、档案交接登记以及禁止个人保存等措施，确保档案的安全、完整和保密。这些措施有助于提高档案管理的效率和准确性，便于长期保存和查询。
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