太原市动车站在小店区。具体信息如下：
地理位置
太原南站（主要动车站）位于太原市小店区北营，地处国家级太原高新区、经济技术开发区及武宿物流区核心地段，东临过境高速公路，西接武宿国际机场，南依南环高速公路，北靠长风大街。
行政区划归属
小店区是太原市辖区，总面积约80平方公里，人口约50万，包含迎泽街道、五一路街道等社区。太原火车站作为小店区的重要交通枢纽，周边分布多个商业区、住宅区和行政区，靠近迎泽公园和五龙口地区。
综上，太原市动车站位于小店区，具体在太原南站内。
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